奶牛乳房炎金黄色葡萄球菌裂解性噬菌体裂解酶LysIMEP5基因的克隆及序列分析

• 作者: 于会举 刘鸽 孙耀强 屈勇刚 张倩 张培生 张湘莉兰 李岩 童贻刚
• 来源期刊: 中国兽药杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 奶牛乳房炎 金黄色葡萄球菌噬菌体 裂解酶 克隆 蛋白结构
• 年，卷（期）: 2016,（10）
• 所属期刊栏目: 微生物与免疫
• 页码范围: 15-21
• 页数: 7页
• 分类号: S852.61
• 字数: 4362字
• 语种: 中文

摘要

为了克隆奶牛乳房炎金黄色(葡萄球菌裂解性噬菌体裂解酶LysIMEP5基因,分析其生物信息学特性,以本实验室分离的奶牛乳房炎金黄色葡萄球菌裂解性噬菌体vB_SauS_IMEP5为材料,根据其全基因组学信息,获取裂解酶基因序列,应用Primer 5.0设计特异性引物.采用PCR方法扩增并克隆LysIMEP5基因,通过BLAST进行序列比对分析,利用在线软件对蛋白结构进行预测.成功克隆到裂解酶LysIMEP5基因,测序结果通过DNAMAN比对与原序列完全匹配,无任何基因突变,同源性分析显示,与已报道的金黄色葡萄球菌噬菌体裂解酶相似性最高为83.1％;裂解酶LysIMEP5基因序列全长1371 bp,共编码456个氨基酸,为亲水性蛋白,分子质量为51.717 kDa,理论等电点为9.70;LysIMEP5同时存在CHAP片段和Amidase-3片段;该蛋白无跨膜区,无信号肽,以无规则卷曲为主.从奶牛乳房炎金黄色葡萄球菌裂解性噬菌体中成功克隆出LysIMEP5基因,通过对该蛋白的结构预测分析为后续克隆表达及开发新型绿色抑菌剂奠定了基础.