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摘要:
通过对‘靖江香沙芋’转录组数据进行功能注释,克隆获得‘靖江香沙芋’淀粉合成酶AGPase的基因,序列全长为1 596 bp,命名为CeApS1 (NCBI:Colocasia KU288757,未公布).该基因编码532个氨基酸,蛋白含有1个NTP_ transf_3结构域(Gly104~Pro306)和1个PbH1结构域(Gly473~Ser515),编码产生AGPase小亚基,等电点和分子量分别为6.73和57.6 kD.ApS1在单子叶和双子叶植物中广泛存在,CeApS1与紫萍(AIZ00992.1)中相应蛋白的亲缘关系最近,相似性为83.4%,与草莓(AAS00541.1)、苜蓿(XP 003617925.1)、水稻(AAK27313.1)和小麦(CAA46879.1)等植物中相应蛋白的亲缘关系较远.CeApS1在‘靖江香沙芋’的母芋和子孙芋中表达量较高,在叶片、叶柄和根中低表达.芋球茎中的CeApS1表达水平与球茎发育密切相关,在播种160 d后达到最大值.该基因的表达模式与球茎淀粉含量的积累显著正相关.
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文献信息
篇名 芋淀粉合成酶AGPase基因的克隆及表达分析
来源期刊 园艺学报 学科 农学
关键词 淀粉合成酶 基因克隆 表达分析
年,卷(期) 2016,(6) 所属期刊栏目 蔬菜
研究方向 页码范围 1117-1125
页数 分类号 S632.3
字数 语种 中文
DOI 10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0301
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 殷剑美 江苏省农业科学院经济作物研究所 66 384 10.0 15.0
2 张培通 江苏省农业科学院经济作物研究所 109 540 12.0 18.0
3 郭文琦 江苏省农业科学院经济作物研究所 50 320 11.0 15.0
4 王立 江苏省农业科学院经济作物研究所 39 111 6.0 7.0
5 韩晓勇 江苏省农业科学院经济作物研究所 43 212 8.0 12.0
6 李春宏 江苏省农业科学院经济作物研究所 38 232 8.0 13.0
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研究主题发展历程
节点文献
淀粉合成酶
基因克隆
表达分析
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园艺学报
月刊
0513-353X
11-1924/S
大16开
北京中关村南大街12号
82-471
1962
chi
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