MicroRNA及其靶基因在预测直肠癌放化疗疗效中的作用

• 作者: 彭啟亮 朱雅群 林宇鑫 袁徐烨
• 来源期刊: 中华放射医学与防护杂志
• 关键词: 直肠癌 放化疗 microRNA 靶基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（10）
• 所属期刊栏目: 放射生物学
• 页码范围: 743-748,752
• 页数: 7页
• 字数: 3901字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5098.2016.10.005

摘要

目的 MicroRNA及其靶基因参与直肠癌放化疗疗效应答,本研究旨在筛选直肠癌放化疗疗效相关的microRNA及其靶基因,推动直肠癌放化疗疗效的基础研究.方法 基于PubMed数据库挖掘与直肠癌放化疗疗效相关的microRNA,结合microRNA-mRNA调控关系以及基因芯片表达谱数据,寻找与直肠癌放化疗疗效相关的靶基因.通过DAVID、IPA等工具对靶基因进行基因本体论和信号转导通路富集分析.结果 通过文本挖掘,共搜集到38个与直肠癌放化疗相关的microRNA,结合实验验证和计算机预测的microRNA-mRNA调控关系,共得到潜在的靶基因3 545个.其中,131个在基因芯片表达谱(GSE35452)中具有显著的差异表达现象(P＜0.05).基因本体论以及信号转导通路富集结果表明,这些基因与直肠放化疗疗效密切相关.结论 上述microRNA及其调控的差异表达基因参与了直肠癌放化疗疗效相关的多条信号通路,在一定程度上从生物机制的角度解释了直肠癌放化疗疗效的差异.同时,筛选出的microRNA及其靶基因也为预测直肠癌放化疗疗效的研究提供了理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林宇鑫	苏州大学系统生物学研究中心	1	4	1.0	1.0
2	袁徐烨	苏州大学系统生物学研究中心	1	4	1.0	1.0