獭兔Tyr基因外显子3多态性检测及序列分析

• 作者: 吴信生 施丽娟 朱杰 翁巧琴 赵博昊 郝晔 闫晓荣 陈阳
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: Tyr基因 外显子3 多态性 序列分析
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医?水产养殖
• 页码范围: 1111-1116
• 页数: 6页
• 分类号: S829.1
• 字数: 3447字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2016.05.025

摘要

以不同獭兔群体为研究对象，采用PCR?SSCP技术检测了Tyr基因外显子3的多态性，针对獭兔Tyr基因外显子3中的碱基突变，进行了生物信息学预测比较分析，以期为獭兔毛色形成机制提供分子生物学基础。结果表明，外显子3存在2个等位基因、3种基因型，A1118C的突变导致编码的赖氨酸变成了苏氨酸。白色和青紫蓝色獭兔各基因型和基因型频率的卡方适合性检验结果显示，BB 基因型频率在青紫蓝色獭兔和白色獭兔中均较高，说明等位基因B是青紫蓝色獭兔群体和白色獭兔中的优势等位基因。 Hardy?Weinberg 平衡检验结果表明，两个群体均处于平衡状态。青紫蓝色獭兔群体的多态信息含量为中度多态（0?25＜PIC＜0?50），白色獭兔群体的多态信息含量为低度多态（ PIC＜0?25）。青紫蓝色獭兔杂合度较高，白色獭兔杂合度较低。生物信息学分析结果表明，外显子3中A1118C的突变未改变TYR蛋白质的理化性质、二硫键、跨膜结构、信号肽、磷酸化位、二级结构和三级结构，但改变了TYR蛋白质的糖基化位点，从而有可能影响到TYR蛋白质的功能。