苜蓿多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白2(MsPGIP2)基因多态性分析

• 作者: 曲泽鹏 桂枝 皮永硕 袁庆华 高建明
• 来源期刊: 草地学报
• 学科: 农学
• 关键词: 紫花苜蓿 PGIP基因 单核苷酸多态性
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1073-1079
• 页数: 7页
• 分类号: S184|Q71
• 字数: 4799字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11733/j.issn.1007-0435.2016.05.022

摘要

本研究旨在分离苜蓿多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白2(MsPGIP2)基因的基因组序列全长,分析序列变异.首先采用引物热不对称PCR的基因组DNA步移法分离其基因组序列全长,然后通过克隆测序分析了MsPGIP2基因在3个苜蓿品种(‘润布勒’、‘苏普斯坦’与‘公农1号’)中的多态性.结果显示,MsPGIP2基因的基因组DNA序列全长1 126 bp,可分为信号肽、内含子和LRR区3部分.MsPGIP2基因的基因组序列中共有46个变异位点(频率＞0.02).在信号肽区,没有变异位点;在内含子区,有5个SNP位点和2个InDel变异位点;而在LRR区,共发现了39个SNP位点,其中非同义突变占61.5％.在3个苜蓿品种中共发现了15个等位基因(即单倍型),通过对LRR区核苷酸的系统发育分析将他们分成3类.结论认为,MsPGIP2基因具有较大的变异,各等位基因间发生了频繁的重组交换,是一个为适应病原微生物PG的进化而快速进化的基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	袁庆华	中国农业科学研究院北京畜牧兽医研究所	114	1720	21.0	34.0
2	高建明	天津农学院农学与资源环境学院	42	363	11.0	16.0
4	桂枝	天津农学院农学与资源环境学院	36	385	12.0	18.0
5	皮永硕	天津农学院农学与资源环境学院	1	3	1.0	1.0
6	曲泽鹏	天津农学院农学与资源环境学院	1	3	1.0	1.0