水稻miR446及其靶基因APP1在非生物胁迫中的功能研究

• 作者: 廖雪洪 李佛生 李锐 艾涛波 陈放
• 来源期刊: 四川大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 水稻 miR446 靶基因 APP1 胁迫
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 1155-1161
• 页数: 7页
• 分类号: Q78
• 字数: 4847字
• 语种: 中文
• DOI: 103969/j.issn.0490-6756.2016.09.033

摘要

根据基因芯片的数据筛选出Osa-miR446及靶基因作为研究对象.生物信息学分析表明,Osa-miR446有4个候选靶基因,通过RACE技术对这些候选靶基因进行鉴定,发现只有LOC_Os03g56930.1 (APP1基因)可得到理想的剪切条带,测序后比对可知该剪切位点位于APP1基因的内含子区域(第1036～1037个碱基).随后,通过克隆获得APP1基因,信息学分析可知该基因开放阅读框长度为711bp,是一个编码237个氨基酸的新的未定性的疏水性蛋白质.Southern杂交结果显示APP1在水稻基因组中为单拷贝基因.利用荧光定量PCR分析了Osa-miR446及其靶基因APP1在非生物胁迫中的表达模式,结果表明Osa-miR446与APP1基因的表达均呈负相关,说明Osa-miR446确实可通过剪切APP1基因的转录产物来对非生物胁迫应答.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈放	四川大学生命科学学院	310	4897	34.0	55.0
2	李锐	四川大学生命科学学院	28	179	7.0	13.0
3	李佛生	四川大学生命科学学院	11	6	1.0	1.0
4	艾涛波		6	14	2.0	3.0
5	廖雪洪	四川大学生命科学学院	2	1	1.0	1.0