甘薯耐旱和耐盐基因的挖掘和表达分析

• 作者: 吴燕 张义正 李雪丹 谭雪梅 颜朗
• 来源期刊: 四川大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 甘薯 转录组 耐旱基因 耐盐基因 基因表达
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 1147-1154
• 页数: 8页
• 分类号: Q75
• 字数: 4529字
• 语种: 中文
• DOI: 103969/j.issn.0490-6756.2016.09.032

摘要

甘薯是世界第7大粮食作物,具有产量高、营养丰富、耐干旱和盐碱等优点.通过转录组学方法,基于国内3个甘薯品种的综合转录组数据库中进行耐旱和耐盐相关转录本序列的挖掘,共获得238个转录本,随机选取9条具有全长编码序列的转录本进行PCR扩增、克隆和测序后,测定序列与组装序列相似度均高于98％,表明转录本序列是可靠的.分析这些转录本在不同甘薯品种间的表达水平时发现,耐旱基因在京薯6号中表达量普遍较高,而在徐薯18中则普遍偏低,而耐盐相关基因的差异表达模式却与之相反.利用数字基因表达谱数据进一步分析耐旱和耐盐基因在徐薯18的6个组织或生长发育阶段中的差异和特异表达,结果显示:耐旱和耐盐基因在成熟叶和膨大期块根中相对于其他组织具有高表达且差异显著.采用荧光定量PCR方法验证结果表明,耐旱和耐盐基因在徐薯18不同组织器官或发育阶段表达情况与数字基因表达谱分析结果基本一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张义正	四川大学生命科学学院四川省分子生物学与生物技术重点实验室	150	2059	26.0	38.0
2	谭雪梅	四川大学生命科学学院四川省分子生物学与生物技术重点实验室	9	14	2.0	3.0
3	吴燕	四川大学生命科学学院四川省分子生物学与生物技术重点实验室	14	30	4.0	5.0
4	颜朗	四川大学生命科学学院四川省分子生物学与生物技术重点实验室	3	5	1.0	2.0
5	李雪丹	四川大学生命科学学院四川省分子生物学与生物技术重点实验室	2	5	1.0	2.0