湖南省草莓灰霉病菌遗传多样性研究

• 作者: 刘双清 廖晓兰 张亚 柏连阳 王翀 马文月
• 来源期刊: 中国蔬菜
• 关键词: 湖南省 草莓灰霉病菌 遗传多样性 SSR标记
• 年，卷（期）: 2016,（7）
• 所属期刊栏目: 研 究 论 文
• 页码范围: 37-43
• 页数: 7页
• 字数: 5734字
• 语种: 中文

摘要

为探明湖南省草莓灰霉病菌群体遗传结构、分化及变异规律，采用荧光标记技术对湖南省9个地理菌群的180株草莓灰霉病菌基因组DNA进行SSR分析。结果表明：9对SSR引物共检测到56个观察等位基因（Na），平均值为6.22；有效等位基因（Ne）为1.27～4.89，平均值为3.44；不同位点的基因多样性指数（H）为0.21～0.80，平均值为0.65；不同位点Shannon’s信息指数（I）为0.37～1.83，平均值为1.34。供试180株样品9个SSR多态性位点上多态性信息量PIC变化范围为0.13～0.91，不同位点PIC差异大，这一规律与I和H基本一致。不同SSR位点总的遗传多样性（Ht）为0.21～0.77，平均值为0.65；群内遗传多样性（Hs）为0.19～0.50，平均值为0.40；遗传分化系数（Gst）为0.10～0.46，平均值为0.37；基因流（Nm）为0.58～4.47，平均值为1.16。不同地理菌群平均观察等位基因（Na）、有效等位基因数目（Ne）分别为2.93和2.07，Shannon’s信息指数（I）平均为0.67，基因多样性指数（H）平均为0.40，平均多态性位点数（NP）、多态位点百分率（P）分别为6.78和75%。依据不同地理菌群之间的遗传距离（0.2797～1.9225），将供试湖南省9个地理菌群分为4大类：第Ⅰ大类主要由长沙、邵阳、岳阳、衡阳、张家界、湘潭种群组成；第Ⅱ大类主要由郴州种群组成；第Ⅲ大类主要由株洲种群组成；第Ⅳ大类由常德种群组成。总之，湖南省各地草莓灰霉病菌群体遗传多样性丰富，但地理群体间差异小，病菌遗传变异主要来自群体内部，不同地区间存在病菌的移动。