辣椒Ty3-gypsy逆转录转座子逆转录酶序列的克隆及分析

• 作者: 余庆辉 唐亚萍 帕提古丽·艾斯木托拉 李宁 杨涛 杨生保 王强 王柏柯
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 Ty3-gypsy逆转录转座子 逆转录酶
• 年，卷（期）: 2016,（12）
• 页码范围: 2166-2174
• 页数: 9页
• 分类号: S641.3|S188
• 字数: 6072字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2016.12.002

摘要

[目的]从辣椒基因组中克隆Ty3-gypsy逆转录转座子逆转录酶序列,分析其家族特性及进化关系.[方法]根据Ty3-gypsy逆转录转座子逆转录酶保守区域设计简并引物,通过PCR扩增、回收、克隆、测序得到的目的基因序列.[结果]克隆从辣椒基因组14条逆转录转座子逆转录酶序列,序列大小均为340 bp左右.生物信息学分析表明,序列长度变化范围为310 ～345 bp,同源性范围为60.2％～99.1％.这些核苷酸序列具有较高的异质性,主要表现为终止密码子突变.聚类分析可将所得序列分为5大类,基于逆转录酶序列进行的不同物种进化树分析显示,第Ⅳ、Ⅴ类序列与荸荠、潘那利番茄等组成一大类,可能是逆转录转座子横向传递的结果.[结论]辣椒Ty3-gypsy逆转录转座子逆转录酶序列具有普遍性、异质性等特点,与荸荠、潘那利番茄等物种的同类型逆转座子可能有相同的起源.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李宁	新疆农业科学院园艺作物研究所	52	341	10.0	17.0
2	杨涛	新疆农业科学院园艺作物研究所	85	384	12.0	16.0
3	王柏柯	新疆农业科学院园艺作物研究所	34	114	7.0	9.0
4	王强	新疆农业科学院园艺作物研究所	50	430	8.0	20.0
5	杨生保	新疆农业科学院园艺作物研究所	29	112	7.0	10.0
6	帕提古丽·艾斯木托拉	新疆农业科学院园艺作物研究所	6	7	2.0	2.0
7	唐亚萍	新疆农业科学院园艺作物研究所	16	31	4.0	5.0