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HER-2阳性和阴性乳腺癌中差异表达蛋白的定量蛋白质组学初步研究
HER-2阳性和阴性乳腺癌中差异表达蛋白的定量蛋白质组学初步研究
作者:
刘志红
刘莉萍
曾亮
李晶
欧阳取长
钟晶敏
高妮娜
黄三钱
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
乳腺肿瘤
受体,表皮生长因子
蛋白质组学
计算生物学
摘要:
目的:通过建立人表皮生长因子受体-2(HER-2)阴性和阳性乳腺癌的蛋白质表达谱寻找二者间的差异表达蛋白,为乳腺癌患者提供新的预后指标和治疗靶点。方法应用蛋白质组学同位素相对标记与绝对定量(iTRAQ)技术建立 HER-2阳性和阴性乳腺癌的蛋白质差异表达谱,分离并鉴定两组乳腺癌的差异表达蛋白,对部分差异表达蛋白进行生物信息学分析,包括蛋白功能注释和分类 GO 分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果应用 iTRAQ 对乳腺癌组织进行蛋白组学分析,鉴定出 HER-2阳性和阴性组有差异表达的蛋白4999种,以 HER-2(+)/HER-2(-)≥3为上调标准,确定 HER-2阳性组上调蛋白119种。以 HER-2(+)/HER-2(-)≤0.5为下调标准,HER-2阳性组下调蛋白47种。GO 分析结果显示 HER-2阴性和阳性乳腺癌的差异表达蛋白的分子功能、生物过程、细胞组成较为复杂,并且在上调蛋白和下调蛋白上存在分布差异。KEGG 通路分析发现部分差异表达蛋白涉及168条信号通路。结论 HER-2阳性和阴性乳腺癌间存在差异表达蛋白,这些蛋白涉及复杂的分子功能、生物过程和信号通路。
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文献信息
篇名
HER-2阳性和阴性乳腺癌中差异表达蛋白的定量蛋白质组学初步研究
来源期刊
国际肿瘤学杂志
学科
关键词
乳腺肿瘤
受体,表皮生长因子
蛋白质组学
计算生物学
年,卷(期)
2016,(10)
所属期刊栏目
论 著
研究方向
页码范围
721-727
页数
7页
分类号
字数
4115字
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.1673-422X.2016.10.001
五维指标
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引文网络
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研究主题发展历程
节点文献
乳腺肿瘤
受体,表皮生长因子
蛋白质组学
计算生物学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
国际肿瘤学杂志
主办单位:
中华医学会
山东省医学科学院
出版周期:
月刊
ISSN:
1673-422X
CN:
37-1439/R
开本:
大16开
出版地:
济南市经十路18877号
邮发代号:
24-64
创刊时间:
1974
语种:
chi
出版文献量(篇)
5900
总下载数(次)
27
总被引数(次)
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