藜科植物藜和灰绿藜实时荧光定量PCR内参基因的选择

• 作者: 兰欣欣 兰海燕 刘艳霞 张晶华 曹婧
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 藜 灰绿藜 实时荧光定量PCR 内参基因 胁迫
• 年，卷（期）: 2016,（12）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 1511-1518,1459
• 页数: 9页
• 分类号: Q945.11
• 字数: 5878字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201601034

摘要

选择合适的内参基因是实时荧光定量PCR(qRT-PCR)研究的关键,目前对藜科耐盐(盐生)植物胁迫相关基因的表达分析中所用内参基因的报道较为有限.该研究利用GeNorm、NormFinder和BestKeeper 3个内参基因分析软件,对已选择过的β-TUBULIN、β-ACTIN、GAPDH 3个常用候选内参基因进行了比较分析,筛选出在NaCl和PEG胁迫下藜和灰绿藜中表达相对稳定的内参基因.结果表明:GeNorm、NormFinder内参软件分析在NaCl和PEG胁迫下,GAPDH是藜和灰绿藜中均共同稳定表达的内参基因,同时在藜和灰绿藜中也有各自表达较稳定的内参基因,β-ACTIN在藜中稳定表达,β-TUBULIN则在灰绿藜中稳定表达.对相同科不同种的植物内参基因表达差异进行比较,内参基因在相同科中具有相同稳定表达的内参;对相同胁迫下两种不同植物内参基因表达稳定性进行分析,内参基因的选择需根据实际的实验材料和实验条件而定.基于3个分析软件对以上3个常用内参基因的分析结果,初步确定了在藜科植物藜和灰绿藜中相对稳定的内参基因,为藜和灰绿藜胁迫相关基因的定量表达分析提供了参考依据.