蓖麻蚕核型多角体病毒的miRNAs生物信息学预测

• 作者: 何庆玲 徐安英 李刚 罗旭芳 钱荷英
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 蓖麻蚕 核型多角体病毒 miRNA 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（10）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 53-61
• 页数: 9页
• 分类号: S885.25
• 字数: 5545字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2016.10.012

摘要

首先在GenBank中下载蓖麻蚕核型多角体（PhcyNPV）全基因组序列，通过生物信息学的方法预测表明， PhcyNPV 基因组中有142条miRNA成熟体分子；再用miRanda、RNAhybird 2个软件预测miRNAs对病毒自身的靶基因，提取有共同交集的33条miRNA。用PhcyNPV感染蓖麻蚕，取感病蓖麻蚕的脂肪体组织，提取总RNA；用逆转录PCR（reverse transcription PCR，简称RT－PCR）验证有共同交集的33条miRNA，确定其中6条为miRNA成熟体序列，分别是Phcy－miR－996＿5p、Phcy－miR－696－5P、Phcy－miR－664＿3p、Phcy－miR－30＿5p、Phcy－miR－217＿5p、Phcy－miR－1483＿3p。这6条可能的miRNA对应的靶基因涉及病毒的融合蛋白、多角体蛋白等结构蛋白，以及一些蛋白激酶包括激活解旋酶表达的极早期基因等，推测其潜在的靶基因参与病毒复制及侵染的重要过程。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李刚		18	51	4.0	7.0
2	徐安英		34	126	5.0	10.0
3	钱荷英		27	71	4.0	7.0
4	何庆玲		5	8	1.0	2.0
5	罗旭芳		4	1	1.0	1.0