中国人群细胞黏附相关基因多态性与非综合征型唇腭裂的关联研究

• 作者: 刘冬静 叶晓茜 吴涛 吴雅慧 王子凡 王科 王竹青 王红 王苹 石冰 袁园 黄尚志
• 来源期刊: 北京大学学报医学版
• 关键词: ACTN1 唇裂 多态现象,遗传 基因相关性研究 基因-环境交互作用
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 论 著
• 页码范围: 403-408
• 页数: 6页
• 分类号: R181.33
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-167X.2016.03.005

摘要

目的：探索中国人群中细胞黏附相关基因多态性与非综合征型唇裂合并或不合并腭裂（isolated non-syndromic cleft lip with or without cleft palate，NSCL／P）的关联关系及可能存在的基因-环境交互作用。方法：对一项国际多中心的全基因组关联研究（genome-wide association study，GWAS）的数据进行再分析，选取其中806个中国人群 NSCL／P 核心家庭，对该人群的8个细胞黏附相关基因包括 CDH1、CTNNB1、PVRL1、PVRL2、PVRL3、ACTN1、VCL、LEF1进行了传递不平衡检验（transmisssion diseqilibrium test，TDT）及基因-环境交互作用分析。环境因素包括患儿母亲孕期吸烟、被动吸烟、饮酒及服用多种维生素。结果：经数据质量控制后，共纳入226个单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms，SNPs）位点，TDT 结果显示，CTNNB1、CDH1、ACTN1基因中有23个 SNPs 与NSCL／P 之间存在关联（P ＜0．05），但经 Bonferroni 校正后，这些关联均无统计学意义（P ＞0．0002）。基因-环境交互作用的分析结果显示，14号染色体的 ACTN1基因中 rs743127位点与母亲孕期被动吸烟的交互作用具有统计学意义（P ＝0．0001），母亲孕期无被动吸烟时携带一个该危险位点的患儿的 OR 值为0．59（95％CI：0．38－0．90），患儿母亲孕期中有被动吸烟情况时携带一个危险位点的患儿的 OR 值为2．00（95％CI：1．23－3．26）。而 ACTN1基因的 rs1475034、rs370535、rs2273419位点、CTNNB1基因的 rs106871位点与被动吸烟和 PVRL3基因的 rs7634000、rs2971366、rs2634553、rs1489032、rs7624812位点与母亲孕期补充维生素的交互作用并无统计学意义（P ＞0．0002）。结论：传递不平衡检验未发现所纳入的细胞黏附相关基因多态性与 NSCL／P 存在关联，但基因-环境交互作用分析结果提示，ACTN1基因可能通过基因-环境交互作用而影响 NSCL／P 的发病风险。