Hadoop框架下节点重要性算法实现蛋白质功能预测

• 作者: 林劼 林志兴 郭金文
• 来源期刊: 计算机系统应用
• 关键词: 蛋白质序列 功能预测 循环匹配 节点重要性 Hadoop平台
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 页码范围: 77-82
• 页数: 6页
• 字数: 4230字
• 语种: 中文

摘要

论文从蛋白质序列数据的角度出发，通过序列相似度循环匹配构造蛋白质网络，并且通过网络节点重要性排序算法预测蛋白质功能。以节点重要性重要性作为研究对象，在蛋白质网络应用节点重要性算法 PageRank计算网络中蛋白质节点PR值，在Hadoop平台上进行开发实现功能预测的并行计算，减小运行时间。最后通过准确率，召回率以及F1-measure三个指标来衡量结果，并对比传统的功能预测方法，验证结果的有效性。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林志兴	三明学院现代教育技术中心	20	28	3.0	4.0
2	林劼	福建师范大学软件学院	25	138	6.0	11.0
3	郭金文	福建师范大学软件学院	3	0	0.0	0.0