混合感染番木瓜PRSV/PLDMV株系基因组全长cDNA的克隆和实时荧光定量PCR分析

• 作者: 刘芳 周鹏 庹德财 沈文涛 言普 黎小瑛
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 混合感染 PRSV PLDMV 序列分析 绝对定量
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 742-751
• 页数: 10页
• 分类号: S436.67
• 字数: 5004字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2016.04.016

摘要

番木瓜环斑病毒(Papaya ringspot virus,PRSV)与番木瓜畸形花叶病毒(Papaya leaf distortion mosaic virus,PLDMV)存在混合感染的现象,近年来混合感染发病率逐年递增,是一种新的威胁番木瓜种植业的病毒病害.运用RT-PCR和RACE方法从混合感染样品中克隆获得2种病毒基因组全长cDNA,分别命名为PRSV-LM和PLDMV-LM,GenBank登录号分别为KT633943和KT633944,基因组序列大小分别为10 325、10 153 nt(不包括3'端的poly A).序列分析表明:PRSV-LM与单独感染样品中的PRSV海南分离物HN(GenBank登录号:EF183499)的核苷酸序列和氨基酸序列相似性最高,为94％;PLDMV-LM与单独感染样品中的PLDMV海南分离物Hainan-DF(GenBank登录号:JX974555)核苷酸和氨基酸序列相似性最高,分别高达99％和97％.进化树分析显示,PRSV-LM和PLDMV-LM分别与单独感染样品的PRSV和PLDMV海南分离物有共同的进化起源.进一步利用实时荧光定量PCR对混合感染样品的PRSV与PLDMV病毒积累量进行分析,结果表明,混合感染样品中PLDMV病毒积累量大约是PRSV含量的100倍.研究结果为进一步探究PRSV/PLDMV混合感染发病机制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黎小瑛	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	36	352	8.0	18.0
2	沈文涛	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	66	524	11.0	20.0
3	言普	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	33	132	5.0	9.0
4	刘芳	海南大学环境与植物保护学院	9	39	3.0	6.0
6	庹德财	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	13	24	3.0	4.0