6株鸽源新城疫病毒广西分离株F基因的遗传演化分析

• 作者: 卢冰霞 卢敬专 周英宁 李斌 段群棚 秦毅斌 苏乾莲 蒋冬福 黎珂钰
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 新城疫病毒 F基因 遗传进化 鸽
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 兽医科技
• 页码范围: 79-84
• 页数: 6页
• 分类号: S852.6
• 字数: 3613字
• 语种: 中文

摘要

应用RT-PCR方法对分离自广西不同鸽场的6株鸽源新城疫病毒F基因进行扩增、序列测定和分析.结果显示:只有1株分离株F基因的ORF全长为1 659 bp,编码552个氨基酸,其他5株分离株F基因的ORF全长均为1 662 bp,编码553个氨基酸,6株分离株的F0蛋白裂解位点的序列均为112RRQKRF117,符合强毒株的序列结构特性;核苷酸同源性比较显示,6株分离株与NDV基因Ⅵ型中的Ⅵb亚型同源性最高,为91.3％ ～99.3％(与比利时分离株11 (JX901124)的同源性最高),与其他基因Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅶ、Ⅷ、Ⅸ型毒株的同源性在81.3％～89.2％.与经典强毒株F48E9相比,核苷酸序列同源性为83.6％ ～84.8％,氨基酸序列同源性为89.2％～ 92.4％;与Ⅰ型疫苗株V4、I-2相比,核苷酸同源性分别为83.6％ ～85.1％和82.6％ ～ 84.2％,氨基酸序列同源性分别为88.1％ ～91.3％和87.7％ ～ 90.8％;与Ⅱ型疫苗株LaSota和B1相比,核苷酸同源性分别为81.7％ ～83.9％和82.0％ ～ 83.9％,氨基酸序列同源性分别为86.6％ ～ 89.9％和86.6％ ～ 89.9％.遗传进化分析显示,6株广西鸽源分离株与2011年比利时分离株11 (JX901124)和中国毒株SDS、LLN713、BJP13、LJL404、P4的遗传关系最为接近,位于同一进化树分支上,属于基因Ⅵb亚型.