三疣梭子蟹肠道菌群结构及代谢表型分析

• 作者: 叶央芳 曾廷兰 李荣华 母昌考 王凯 王春琳
• 来源期刊: 分析化学
• 关键词: 三疣梭子蟹 肠道菌群 高通量测序 代谢表型 核磁共振
• 年，卷（期）: 2016,（12）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1867-1873
• 页数: 7页
• 字数: 4938字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11895/j.issn.0253-3820.160432

摘要

建立16S rRNA基因的高通量测序和基于核磁共振( NMR)的代谢组学技术分析三疣梭子蟹肠道菌群结构及代谢物组成的方法。经对梭子蟹肠道样品提取基因组DNA和16 S rRNA基因的V3-V4可变区片段的扩增,产物用于MiSeq测序。经对测序结果进行聚类和注释分析,发现梭子蟹肠道的细菌群落结构以变形杆菌门、拟杆菌门、梭杆菌门、软壁菌门和酸杆菌门为主,其中以发光杆菌属、Paludibacter和产丙酸菌属的细菌丰度最高。梭子蟹肠道样品经组织破碎、甲醇-水(2：1, V/V)提取、高速离心和冷冻干燥后,重悬在钠钾磷酸盐缓冲液中,用于NMR分析。采用标准的 Noesypr1D脉冲序列采集1 H NMR谱,设置90o脉冲宽度约为10μs,等待时间为2 s,混合时间为100 ms,谱宽为20 ppm,采样点数为32 K,自由感应衰减累加次数为64。再利用2D NMR谱对肠道代谢物进行归属,共获得包括氨基酸、有机羧酸和有机胺类等30种代谢产物。本方法可用于系统分析梭子蟹肠道菌群及其代谢物组成。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	母昌考	宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室	59	340	10.0	14.0
2	王凯	宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室	26	126	6.0	10.0
3	李荣华	宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室	37	160	8.0	10.0
4	曾廷兰	宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室	2	9	1.0	2.0