人巨细胞病毒US31基因序列特征分析及B细胞表位预测

• 作者: 叶思思 孙祥威 张丽芳 张良 薛向阳 谢尙丹 郭刚强
• 来源期刊: 温州医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 人巨细胞病毒 US31基因 B细胞表位
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 页码范围: 781-786
• 页数: 6页
• 分类号: R373.9
• 字数: 3850字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-9400.2016.11.001

摘要

目的：分析人巨细胞病毒（HCMV）US31基因序列，预测US31基因编码蛋白的B细胞优势表位。方法：基于US31基因编码蛋白的氨基酸序列，结合亲水性参数、可及性参数、抗原性参数、柔韧性参数及二级结构方案对HCMV US31基因编码各型蛋白的B细胞表位进行预测，参照已建立的预测方法综合评价US31基因B细胞优势表位。结果：US31核苷酸序列变异较少，大部分是同义突变，氨基酸序列高度保守；其编码蛋白全长为162个氨基酸，相对分子质量20 kD，等电点7.66，为可溶性蛋白，二级结构中以无规则卷曲为主。经综合分析，US31基因的B细胞优势表位可能存在于氨基酸序列N端的5～19、32～47、58～68、110～124区段。结论：多参数预测HCMV pUS31的B细胞优势表位，为进一步研究蛋白特征、制备单克隆抗体及表位疫苗提供依据。