转录组测序技术在筛选大鼠肺动脉高压模型分子标记中的应用

• 作者: 余莉 刘瀚旻 胡梵 谢亮 陈娇
• 来源期刊: 中华儿科杂志
• 关键词: 基因 高血压,肺性 大鼠
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 心血管疾病研究
• 页码范围: 273-277
• 页数: 5页
• 字数: 3983字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0578-1310.2016.04.009

摘要

目的 通过转录组测序技术筛选大鼠重度肺动脉高压形成相关的基因和通路.方法 采用左肺切除+野百合碱皮下注射的方法建立SD大鼠肺动脉高压动物模型.取术后注射野百合碱1、3、5周大鼠各8只分别命名为M1、M2、M3组,另取正常大鼠8只命名为C组.对各组大鼠右肺组织进行高通量转录组测序,筛选得到差异表达基因.同时对差异基因进行KEGG富集分析.结果 大鼠肺动脉高压模型建立成功,各组平均肺动脉压力如下:C组(28.6 ±3.0) mmHg(1 mmHg=0.133 kPa),M1组(38.9±3.3) mmHg,M2组(50.8±3.9) mmHg,M3组(51.5±3.5)mmHg.M1组明显高于C组,差异有统计学意义(P =0.007),M2组明显高于M1组,差异有统计学意义(P=0.002),M3组明显高于M1组,差异有统计学意义(P ＜0.001),M3组与M2组相比差异无统计学意义(P=1.000).经转录组测序筛发现内皮细胞酪氨酸激酶受体(Tie2)基因在肺动脉高压形成的早期出现下调(q ＜0.005),而在后期出现上调(q＜0.005),凝血酶敏感蛋白1(TSP-1)基因在肺动脉高压形成的早期出现上调(q＜0.005),而在后期出现下调(q＜0.005).在中晚期肺动脉高压阶段差异表达基因富集的信号通路主要是磷脂酰肌醇3激酶、黏附斑激酶以及细胞外基质受体相互作用通路.结论 本实验提供了大鼠肺动脉高压模型的转录本信息,为中晚期肺动脉高压机制的探索提供了线索,为肺动脉高压的诊断和治疗提供了可能的分子标志物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈娇	四川大学华西第二医院儿科	69	311	10.0	13.0
2	刘瀚旻	四川大学华西第二医院儿科	58	409	9.0	18.0
3	余莉	四川大学华西第二医院儿科	18	63	4.0	7.0
4	胡梵	四川大学华西第二医院儿科	6	23	3.0	4.0
5	谢亮	四川大学华西第二医院儿科	8	18	3.0	4.0