RNA-seq转录组测序分析不同季节对槟榔江水牛精液品质的影响

• 作者: 张敬旸 李莲 王根林 耿红红
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: RNA-seq 槟榔江水牛 差异表达基因 精液品质
• 年，卷（期）: 2016,（7）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 1373-1380
• 页数: 8页
• 分类号: S823.8+3
• 字数: 5511字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2016.07.009

摘要

本研究旨在利用RNA-seq技术对不同季节槟榔江水牛全血mRNA进行分析,找出不同季节精液品质候选基因.选取5头生长状况相近的3～5岁槟榔江水牛,进行春、夏、秋、冬4个季节的精液品质(鲜精活力、精子畸形率、射精量、精子密度)检测.根据精液品质,选取差异极显著的春(BL)、夏(SBL)两个季节的水牛样品进行RNA-seq转录组测序分析.颈静脉采集全血,抽提mRNA并组内混合制样,利用RNA seq技术分析不同季节槟榔江水牛全血mRNA差异表达.根据差异倍数＞1.5,P＜0.05的标准进行筛选,得到差异基因,再利用DAVID 6.7软件对差异基因进行GO和KEGG分析,通过RT-PCR验证基因芯片结果的准确性.结果表明:差异表达基因84个,其中上调基因56个,下调基因28个;GO分析发现,这些差异基因与应激反应、免疫反应有关;KEGG分析表明,差异基因显著富集到肿瘤坏死因子(TNF)和T细胞受体信号通路.其中,神经营养因子受体类似物死亡结构域(NRADD,又叫热休克蛋白因子1(HSF1)、原癌基因FOS和JUN,与精液品质相关性强,可作为进一步研究的靶基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王根林	南京农业大学动物科技学院	137	1731	24.0	36.0
2	李莲	南京农业大学动物科技学院	24	211	8.0	14.0
3	耿红红	南京农业大学动物科技学院	1	3	1.0	1.0
4	张敬旸	南京农业大学动物科技学院	1	3	1.0	1.0