番茄热激转录因子HSF家族的系统进化分析

• 作者: 仇有文 伍淼 杨俊颖 王傲雪 王婷婷 王沛文 王窦逗 陈宏宇
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄 热激转录因子(HSF) 基因家族 生物信息学 系统进化
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 48-53
• 页数: 6页
• 分类号: S641.203
• 字数: 4010字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2016.01.012

摘要

热激转录因子(heat Shock factors)普遍存在于整个生物界中,在调控植物生长发育以及对环境的响应中起重要作用.目前,已经对多个物种的HSF基因进行生物信息学分析,但未见对番茄中HSF基因家族的分析报道.通过番茄基因组数据库,鉴定和分析番茄HSF转录因子家族,获得24个HSF基因家族成员.多重序列比对发现番茄HSF基因具有保守的DBD结构域和广泛的保守基序.根据与拟南芥基因系统进化分析将这些基因分类,分成Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ支,又将1支分成A、B、C3个亚支,并且存在5对旁系同源蛋白和10对直系同源蛋白.染色体分布和遗传分析结果表明,番茄HSF基因存在于10条染色体上,呈不均匀分布.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王傲雪	东北农业大学园艺学院	79	525	12.0	18.0
2	仇有文	东北农业大学园艺学院	4	75	3.0	4.0
3	陈宏宇	东北农业大学园艺学院	7	61	4.0	7.0
4	伍淼	东北农业大学园艺学院	3	6	1.0	2.0
5	王婷婷	东北农业大学园艺学院	17	69	6.0	8.0
6	杨俊颖	东北农业大学园艺学院	3	6	1.0	2.0
7	王窦逗	东北农业大学园艺学院	3	3	1.0	1.0
8	王沛文	东北农业大学园艺学院	4	16	1.0	4.0