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红花脂质转运蛋白基因的克隆及表达分析
红花脂质转运蛋白基因的克隆及表达分析
作者:
吴贯达
官丽莉
崔琪
李校堃
李海燕
武云云
滕孝花
胡人阁
韩怡来
顾天瑶
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
脂质转运蛋白
红花
荧光定量 PCR
生物信息学分析
摘要:
克隆红花脂质转运蛋白基因(Lipid transfer protein,LTP),并进行生物信息学及表达分析,旨为研究 LTP 在红花抵抗逆境胁迫中的作用提供依据。通过 RT-PCR 方法从红花种子中克隆 LTP 基因序列,通过生物信息学对该基因蛋白的特征进行分析,构建 LTP 与相关物种 LTP 的系统进化树,利用 Real-time PCR 方法分析在红花不同号组织中 LTP 基因的表达量。结果显示,LTP基因 ORF 全长294 bp,编码97个氨基酸,相对分子量为7.46 kD,等电点为8.91。红花 LTP 蛋白包含一个长为29个氨基酸残基的信号肽序列;该蛋白含有一个丝氨酸磷酸化位点;三级结构预测表明该蛋白是由3个α-螺旋和一个β-转角简单的缠绕在无规则卷曲上的简单结构。分子进化表明,红花 LTP 基因与十字花科的甘蓝型油菜进化关系最近。通过荧光定量 PCR 对红花 LTP 基因的组织表达特异性进行分析,结果表明 CtLTP 在不同组织的表达水平具有显著差异,在种子和花中呈现高表达,而在其他组织中低表达。
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红花脂质转运蛋白基因的克隆及表达分析
来源期刊
生物技术通报
学科
关键词
脂质转运蛋白
红花
荧光定量 PCR
生物信息学分析
年,卷(期)
2016,(7)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
146-151
页数
6页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.07.022
五维指标
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主办单位:
中国农业科学院农业信息研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1002-5464
CN:
11-2396/Q
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区中关村南大街12号
邮发代号:
18-92
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
7180
总下载数(次)
42
总被引数(次)
53964
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