菠萝MADS-box基因AcMADS2的克隆与表达分析

• 作者: 吴青松 孙伟生 孙光明 张治礼 杨祥燕 王运儒 蔡元保
• 来源期刊: 植物生理学报
• 关键词: 菠萝 MADS-box基因 克隆 基因表达
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1406-1412
• 页数: 7页
• 语种: 中文

摘要

采用RT-PCR和RACE方法从菠萝克隆获得一个MADS-box基因,命名为AcMADS2, GenBank登录号为KC257409。Ac-MADS2基因cDNA全长945 bp, ORF为687 bp,编码一个含有228个氨基酸的蛋白。序列分析和系统进化分析表明, Ac-MADS2具有保守的MADS-box结构域和半保守的K区,与其他植物中的AGL12亚家族MADS-box蛋白具有很高的同源性。生物信息学分析结果表明, AcMADS2是不稳定的亲水蛋白,不具有跨膜结构和信号肽。α-螺旋、折叠延伸链及无规则卷曲构成了二级结构的主要蛋白框架。在三级结构中MADS-box结构域构成了该蛋白核心结构,并且作为转录因子可能定位于细胞核。实时荧光定量PCR分析表明, AcMADS2基因在花期根中的表达量明显高于同一时期的小花、茎和叶；干旱和低温胁迫处理后, AcMADS2基因在苗期根中的表达也明显增强。因此,推测AcMADS2基因可能参与菠萝根发育的调控以及逆境胁迫反应。