小麦抗白粉病基因 Pm43定位区段内 RGA 分析

• 作者: 乔麟轶 冯建宁 刘静 张小辉 张晓军 李欣 畅志坚 詹海仙 郭慧娟
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: Pm43 小麦基因组 2D 染色体 PK NBS
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 页码范围: 26-30
• 页数: 5页
• 分类号: S435.121.4+6|Q78
• 字数: 2758字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2016.04.005

摘要

利用普通小麦测序草图可从基因组范围内对小麦单条染色体上的某个区段进行分析。Pm43是作物遗传与分子改良山西省重点实验室在小麦2D 染色体长臂上定位的一个抗白粉病基因。利用信息学方法分析 Pm43所在物理图谱、遗传图谱和基因组图谱上的位置，可为其精细定位乃至候选基因的确定提供参考。试验采用 Pm43两侧标记序列进行比对，将 Pm43定位于染色体 C-2DL3-0．49区间的79～99 cM 内，所在基因组区段为2DL ＿9835990～2DL＿9823315。利用目前已克隆小麦抗病基因的保守基序作为探针，从目标区段内检索出89条包含抗病基因类似物（Resistance gene analogues，RGA）序列的 scaffold，其中，36条 scaffold 被诊断出含有 SSR 位点，之后针对 SSR 位点开发分子标记。利用携带有 Pm43的普通小麦材料 CH5025、感白粉病材料台长29以及 CH5025×台长29的 F2作图群体的抗感池 DNA，对开发的 SSR 标记进行连锁性检测，共筛选出4个多态性标记，从而将目标区段进一步确定在标记PK＿9908430和 NBS＿9908778之间。最后经聚类分析，筛选出与已克隆 Pm 基因同源性较高的1个 PK 序列和1个 NBS序列，且在粗山羊草2D 染色体和水稻第4染色体中均存在与这2个序列同源的 RGA 表达序列。