一种构建基因调控网络的混合算法

• 作者: 刘飞
• 来源期刊: 信息技术
• 学科: 工学
• 关键词: 基因调控网络 贝叶斯网络 互信息测试 打分函数
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 基金项目
• 页码范围: 72-74,78
• 页数: 4页
• 分类号: TP39
• 字数: 2261字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13274/j.cnki.hdzj.2016.01.019

摘要

基因调控网络的重构是系统生物学一个热门研究领域,其中条件互信息是一种很实用的方法.文中提出一种基于条件互信息和爬山搜索策略相结合的混合算法,并应用于大量的基因表达数据,结果证明能提高基因调控网络构建的精确度.条件互信息可以确定变量之间的条件独立性,既可以识别变量间线性关系,也可以识别变量间的非线性关系.这种方法使用打分搜索策略来确定变量X或者Y的邻接点.在有n个变量和n个样本的DREAM数据集以及包含9个变量和9个样本的大肠杆菌数据集中,应用文中方法进行仿真测试,结果显示文中方法能提高基因调控网络的构建精度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘飞	宝鸡文理学院物理与光电技术学院	35	44	3.0	4.0