潜伏性结核菌感染者血浆长链非编码RNA表达谱差异分析

• 作者: 周俭中 林伟基 梁丽娟 欧青叶 董秋兰 顾大勇
• 来源期刊: 中华检验医学杂志
• 关键词: 潜伏性结核 RNA,长链非编码
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 857-863
• 页数: 7页
• 字数: 5293字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2016.11.014

摘要

目的：探讨长链非编码RNA （ lncRNA ）在潜伏性结核菌感染中差异性表达。方法选择2015年1至6月在珠海市慢性病防治中心诊断的潜伏性结核菌感染患者血浆33例（病例组），纳入标准为年龄范围18～40岁，确诊的涂阳肺结核病例密切接触者；胸部影像学检查正常；皮肤结核菌素试验强阳性；6个月后随访未患活动性肺结核。对照组选自同一机构体检科健康人群血浆33名，纳入标准为年龄范围18～40岁，排除肺结核或其他肺部疾病，皮肤结核菌素试验阴性。病例组和对照组各3例用于lncRNA芯片实验，30例用于RT－PCR验证实验。 Trizol法抽提总RNA后，利用lncRNA芯片技术进行高通量检测，建立潜伏性结核菌感染者的lncRNA基因表达谱。筛选6个差异表达明显的lncRNA，利用实时定量PCR技术，在30例扩大化样本中进行验证，获得高灵敏度、高特异性的生物标志物。利用基因功能分析、基因通路分析初步分析差异基因的表达功能。数据的正态性检验采用Kolmogorov－Smirov（K－S），正态分布资料两个样本均数比较采用t检验，多个样本均数比较采用单因素方差分析，两样本率的比较用χ2检验。结果潜伏性结核感染的特异性差异表达lncRNA共1485个，占所检测lncRNA 总数的4．9％，其中上调819个，下调666个。 ENST00000566054（ t＝10．92，P＜0．001）、TCONS＿00016510（t＝2．98，P＝0．004）在潜伏性结核菌感染者血浆中表达水平显著上调，NR＿034120表达水平显著下调（ t＝－16．63， P＜0．001）。基因功能分析中，上调表达的mRNA中，有382个基因富集于生物学进程、60个基因富集于细胞组件、43个基因富集于分子功能；下调表达的mRNA中，有276个基因富集于生物学进程、55个基因富集于细胞组件、55个基因富集于分子功能；基因通路分析上调的mRNA主要富集于7条生物学途径，下调的mRNA主要富集于7条生物学途径。结论 lncRNA在潜伏性结核菌感染血浆中异常表达，提示lncRNAs参与潜伏性结核菌感染的分子调节过程。（中华检验医学杂志，2016，39：857－863）

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	顾大勇		13	41	4.0	6.0
2	周俭中		5	16	3.0	4.0
3	董秋兰		2	7	2.0	2.0
4	梁丽娟		3	24	2.0	3.0