基于玛氏骨条藻(Skeletonema marinoi)转录组的碳固定代谢途径分析

• 作者: 于志刚 刘乾 王华龙 甄毓 米铁柱
• 来源期刊: 科学通报
• 关键词: 玛氏骨条藻 碳固定代谢途径 转录组
• 年，卷（期）: 2016,（22）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 2483-2493
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.1360/N972016-00046

摘要

以玛氏骨条藻(Skeletonema marinoi)转录组信息为基础,分析了其碳固定代谢途径,共发现18种酶对应的34个编码基因,构建了玛氏骨条藻进行碳固定代谢途径的通路图.这些编码基因的序列比对结果表明,其与假微型海链藻(Thalassiosira pseudonana)的同源基因具有较高的一致性.对这些样品进行数字基因表达谱的差异基因分析,获得了不同生长时期碳固定代谢途径酶编码基因的差异表达情况.通过分析发现,C3和C4代谢途径中存在表达差异的基因分别有7和3个,其中果糖-1,6-二磷酸酶和丙酮酸磷酸双激酶的编码基因表达在指数生长期之后出现显著上调.这有助于对玛氏骨条藻碳固定代谢途径中关键编码基因调控过程的解析,为进一步研究硅藻的固碳机制奠定了基础,也为深入了解碳的生物地球化循环提供了新的研究方向.