8种模式生物的miRNA比较分析

• 作者: 冯世鹏 刘梦佳
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: miRNA pre-miRNA 保守性 GC含量 碱基偏好性
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 629-633
• 页数: 5页
• 分类号: Q74
• 字数: 3998字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2016.05.006

摘要

目的:分析物种间miRNA序列的共同点和差异点,为后续miRNA研究奠定基础.方法:从miRBase数据库下载8种模式生物,即智人、小鼠、大鼠、果蝇、线虫、拟南芥、水稻、玉米的全部miRNA,通过生物信息学相关软件及方法对其进行分析.结果:各物种成熟miRNA序列长度均约为22 nt,植物miRNA长度分布范围较动物更集中;而pre-miRNA则相反,植物pre-miRNA的长度变异远大于动物;各物种miRNA序列第一个碱基倾向于U,而其他位点的碱基在不同物种间变异较大;miRNA的保守性有一定的范围,不存在在所有物种中均保守的miRNA.结论:找到了miRNA间的一些共同点及差异点,可为后续miRNA鉴定注释提供借鉴.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冯世鹏	海南省热带生物资源可持续利用重点实验室海南大学农学院	2	2	1.0	1.0
2	刘梦佳	海南省热带生物资源可持续利用重点实验室海南大学农学院	1	2	1.0	1.0