利用 EST－SSR、IT－ISJ 分子标记研究四倍体与八倍体柳枝稷的遗传多样性

• 作者: 严海东 周思凡 张新全 张爱玲 罗茜 钟鸣 黄琳凯 黄秀
• 来源期刊: 草业学报
• 关键词: 柳枝稷 EST-SSR IT-ISJ Alamo 分子标记 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2016,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 113-123
• 页数: 11页
• 字数: 5247字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11686/cyxb2015554

摘要

柳枝稷是重要的能源植物之一，为研究四倍体 Alamo 与通过秋水仙素加倍后的八倍体之间的遗传差异，本研究以65份四倍体 Alamo 与其诱变的八倍体为研究材料，通过 EST－SSR 与 IT－ISJ 两种分子标记进行遗传分析。结果表明，EST－SSR 引物共扩增出245条带，多态性比率为99．59％，观测等位基因 Na 为1．9878，有效等位基因Ne 为1．1718，基因多样性指数 H 为0．1308，Shannon 信息指数 I 为0．2388，其中四倍体 Alamo 的各遗传参数（226条，88．93％，1．8816，1．1823，0．1349，0．2398）多高于八倍体 Alamo （217条，92．24％，1．9184，1．1652，0．1228，0．2234）。IT－ISJ 引物共扩增出165条条带，多态性比率为96．36％，观测等位基因 Na 为1．9878，有效等位基因Ne 为1．5777，基因多样性指数 H 为0．3354，Shannon 信息指数 I 为0．4999，四倍体 Alamo 各项指数（145条，94．55％，1．9333，1．6366，0．3602，0．5280）均高于八倍体 Alamo （139条，84．24％，1．7515，1．4377，0．2573，0．3864）。通过 UPGMA 分析表明，65个柳枝稷材料中四倍体与八倍体没有明显区分开，表明其没有产生明显的遗传分化。通过 AMOVA 分析表明，EST－SSR 和 IT－ISJ 的遗传变异分别有94．78％和80．76％发生在倍性内，有5．22％和19．24％发生在倍性间，表明柳枝稷倍性间没有明显的差异。