宏基因组靶向测序分析皮肤表面微生物群落方法优化

• 作者: 刘文丽 姚雪 童贻刚 罗亚平 裴广倩
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 皮肤表面微生物群落 宏基因组靶向测序 16S rRNA 基因
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 137-143
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.11.016

摘要

通过实验设计和数据分析，筛选出尽可能真实反映含量较低的皮肤微生物群落的高通量测序分析方法。使用多因素多水平完全随机实验设计，分析 DNA 提取、PCR 扩增、样品采集、测序过程中各种实验因素对微生物群落组成特征分析结果的影响。结果显示，在样品采集方面，筛选出了最佳的采集拭子与采集液体；在 DNA 提取方面，筛选出了最佳的前处理方法及试剂盒种类；在 PCR 反应方面，筛选出了最佳的模板浓度及退火温度；在测序方面，筛选出了合适的测序深度。通过一系列的实验条件筛选，确定了适合分析低含量细菌群落结构组成特征的方法，并成功地应用于人类手掌面皮肤。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	童贻刚	军事医学科学院微生物流行病研究所	58	363	11.0	17.0
2	罗亚平	中国人民公安大学刑事科学技术学院	81	237	8.0	9.0
3	姚雪	中国人民公安大学刑事科学技术学院	7	8	2.0	2.0
4	刘文丽	军事医学科学院微生物流行病研究所	3	2	1.0	1.0
5	裴广倩	军事医学科学院微生物流行病研究所	6	9	1.0	3.0