东南亚62个籼型水稻亲本SSR遗传多样性分析

• 作者: 从夕汉 张效忠 施伏芝 罗志祥 阮新民
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 水稻 功能基因 遗传多样性 SSR标记
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 859-868
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2016.05.0859

摘要

为探讨东南亚水稻亲本间的遗传多样性,以东南亚62份籼型水稻亲本为材料,选择29对水稻功能基因标记以及平均分布于12条染色体、多态性较高和条带清晰的72对SSR引物进行遗传多样性和聚类分析.结果表明,32对多态性引物在62份水稻材料中检测到201个等位基因,每个位点等位基因数(Na)变异范围为2 ～12,平均为6.281;有效等位基因数(Ne)变异范围为1.067～5.399,平均为2.867;多态信息含量(pIC)变异范围为0.061～0.789,平均为0.515;平均Shannon信息指数(I)为1.176,变幅为0.143 ～ 1.908;观察杂合度(Ho)为0.977,范围为0.936 ～ 1.000;期望杂合度(He)为0.439,范围为0.179 ～ 0.937;固定指数(Fis)的范围为0.882 ～1.000;基因流(Nn)的范围为0～0.0157.聚类分析表明,在遗传相似系数为0.805处,东南亚水稻亲本被分为6大类,同一国家大多数品种聚为一类.相对于普通分子标记,功能基因标记的平均等位基因数不高,其遗传多样性参数也低于普通分子标记,东南亚各国水稻品种间的亲缘关系较近,遗传多样性程度较低.研究结果为水稻育种亲本选配、新种质资源的创制以及杂种优势利用等提供了科学依据.