A型口蹄疫病毒(FMDV)VP1基因遗传进化分析

• 作者: 安添午 庞倩 徐岳松 徐鹏卫 杨江 罗晓林 范辰韵 许路来 高文倩
• 来源期刊: 四川大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 口蹄疫病毒 VP1 A型 进化树分析
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 430-436
• 页数: 7页
• 分类号: Q933|S852
• 字数: 4478字
• 语种: 中文
• DOI: 103969/j.issn.0490-6756.2016.03.030

摘要

对疑似感染FMDV的样本进行了FMDV VP1基因RT-PCR鉴定,测定了其中1个阳性样本序列(命名为HY).采用生物信息学软件比较了HY与参考序列的同源性,并构建VP1基因的分子系统树.结果表明:HY属A型FMDV亚洲拓扑型东南亚-97谱系,与我国近年来报道的A/GDMM/CHA/2013的序列相似性为99.1％,与AF/72疫苗株的相似性仅为79.0％.提示我国近年来报道的A型毒株与AF/72疫苗株的序列差异较大,应及时更换A型口蹄疫疫苗毒株.