软体动物牡蛎肌联蛋白一级结构的预测

• 作者: 包玉龙 周好乐 张三润 徐宋瑶
• 来源期刊: 畜牧与饲料科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 生物信息学 基因组 肌联蛋白 同源蛋白
• 年，卷（期）: 2016,（12）
• 所属期刊栏目: 基础科学
• 页码范围: 5-8
• 页数: 4页
• 分类号: Q516
• 字数: 2528字
• 语种: 中文

摘要

旨在预测牡蛎肌联蛋白的基因exon-intron结构,并确定其一级结构及结构域.利用生物信息学方法,从牡蛎基因组数据中预测肌联蛋白基因的exon-intron结构,并进一步预测编码肌联蛋白的mRNA组成,从而确定该蛋白的一级结构,并检测其结构域;与同源蛋白进行序列比对,制作系统进化树以了解其在系统进化中的位置.结果表明,该蛋白基因在基因组中横跨200 kb的序列区域,预测编码肌联蛋白的mRNA大约由74 kb组成,推测相对分子质量约为2700 ku;该蛋白由Ig、Fn、kinase结构域,PEVK结构域和unique序列组成;在系统发育方面,该蛋白归属于原口动物集团.牡蛎肌联蛋白是一种新型的肌联蛋白样蛋白.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周好乐	内蒙古医科大学基础医学院	35	111	6.0	8.0
2	张三润	内蒙古医科大学基础医学院	20	82	5.0	8.0
3	徐宋瑶	内蒙古医科大学基础医学院	5	8	1.0	2.0
4	包玉龙	内蒙古医科大学基础医学院	9	25	3.0	4.0