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COPD动态miRNA表达谱的构建及生物信息学分析
COPD动态miRNA表达谱的构建及生物信息学分析
作者:
卢俊娟
孙圣华
林桦
谢丽华
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
慢性阻塞性肺疾病
miRNA
微芯片
生物信息学
摘要:
目的 构建慢性阻塞性肺疾病(COPD)动态大鼠模型不同时期肺组织miRNA表达谱,并对差异表达的miRNAs进行生物信息学分析,以了解COPD发生发展中miRNAs变化规律及可能涉及相关机制.方法 1)将大鼠随机分为对照组、吸烟2、4、6、8周组和15周+气管内滴注猪胰弹性蛋白酶组,每组5只,病理学观察其形态学改变;2)取对照组、吸烟4周和15周+气管内滴注猪胰弹性蛋白酶组大鼠肺组织各2例,用于miRNA表达谱芯片分析;3)实时荧光定量PCR法验证芯片数据;4)运用生物信息学法对miRNA表达谱进行靶基因预测及聚类分析.结果 1)成功建立COPD动态大鼠模型,该鼠肺组织早期以出现炎性细胞浸润为主,晚期出现肺气肿改变的动态病理变化;2)成功建立miRNAs动态表达谱,熏烟4周组共30个miRNAs异常表达,熏烟15周组共37个miRNAs异常表达;3)实时荧光定量PCR法证实miR-146a、miR-21、miR-206和miR-181a变化趋势与芯片一致;4)生物信息学分析显示异常表达的miRNAs可能与COPD发病机制密切相关.结论 1)成功构建动态COPD大鼠模型及miRNA表达谱.2)通过生物信息学分析异常表达的miRNA可能在COPD发病机制中发挥重要作用.
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篇名
COPD动态miRNA表达谱的构建及生物信息学分析
来源期刊
基础医学与临床
学科
医学
关键词
慢性阻塞性肺疾病
miRNA
微芯片
生物信息学
年,卷(期)
2016,(6)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
739-746
页数
8页
分类号
R563.3
字数
3047字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
孙圣华
中南大学湘雅三医院呼吸科
75
475
11.0
17.0
2
林桦
中南大学湘雅三医院呼吸科
15
104
5.0
9.0
3
谢丽华
中南大学湘雅三医院呼吸科
21
104
6.0
9.0
4
卢俊娟
中南大学湘雅三医院呼吸科
3
10
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参考文献(1)
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miRNA
微芯片
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
基础医学与临床
主办单位:
北京生理科学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-6325
CN:
11-2652/R
开本:
大16开
出版地:
北京东单三条5号
邮发代号:
82-358
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
7613
总下载数(次)
10
总被引数(次)
29500
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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