miR-92基因进化及在鸡不同发育时期组织表达谱和其功能预测分析

• 作者: 孙桂荣 康相涛 张蒙 李国喜 李芳 李转见 王彦彬 蒋可人 韩瑞丽
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: miR-92 进化 鸡 差异表达 靶基因 通路分析
• 年，卷（期）: 2016,（10）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 9-15
• 页数: 7页
• 分类号: S811.5
• 字数: 5276字
• 语种: 中文

摘要

microRNA(miRNA)在不同物种间进化具有高度保守性,且在动物生长发育过程中有重要作用.为研究miR-92的进化历史、miR-92在不同组织的表达差异性和在生长发育过程中的作用,本文运用多序列比对分析序列相似性,并构建系统进化树分析miR-92基因的进化特点,运用SYBR Green System PCR技术构建了miR-92在鸡不同发育阶段11个组织中的表达谱,同时用TargetScan 7.0与PicTar两种不同生物学软件对其进行靶基因预测,两个软件靶基因的交集分别进行GO和KEGG富集分析.结果表明:(1)miR-92的进化方向与物种从低等到高等的进化趋势相一致,在不同物种中的基因位置和序列上都表现出较高的相似性,这与miRNA在物种间高度进化保守性的特点基本一致;(2)同一个时期,不同组织部位的表达有组织特异性,在1日龄的鸡中,肾脏,腿肌和心脏有较高的表达量.在成年鸡中,表达量较高的组织为肺脏,胸腺和下丘脑.在同一组织的1日龄和成年鸡中的表达呈现时序性,除脾脏的表达量差异不显著外,其他10个组织miR-92的表达量差异显著(P＜0.05);(3)两个软件预测到的交集靶基因有157个,GO富集结果显示靶基因主要参与转录过程,RNA代谢过程,DNA结合,转录因子活性,MAPK磷酸酶活性等.显著富集的KEGG通路为MAPK信号通路(P＜0.05).这些结果为进一步研究miR-92基因在机体中所扮演的角色奠定了基础.