霍山石斛cpDNA全序列微卫星分布及分子鉴别研究

• 作者: 刘枫 姚厚军 戴军 赵群 陈乃富 陈存武 韩邦兴
• 来源期刊: 中药材
• 学科: 医学
• 关键词: 霍山石斛 叶绿体基因组 微卫星 引物设计 分子鉴定
• 年，卷（期）: 2016,（12）
• 所属期刊栏目: 资源和鉴别
• 页码范围: 2720-2724
• 页数: 5页
• 分类号: R282.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.13863/j.issn1001-4454.2016.12.011

摘要

目的:探讨霍山石斛的叶绿体基因组(chloroplast genomic DNA,cpDNA)中微卫星分布规律并设计引物鉴别霍山石斛及其伪品.方法:利用GenBank上已公布的霍山石斛cpDNA全序列,应用分子生物学软件对霍山石斛cpDNA中的微卫星位点统计分析,并设计筛选特异性引物对霍山石斛进行鉴别.结果:霍山石斛cpDNA中微卫星位点共有52个,以单碱基重复序列为主,共有25个,占总位点48％,其次二碱基重复序列有16个,占总位点30.8％,三碱基及三碱基以上重复序列在cpDNA中分布极少.在通过微卫星位点所设计的4对引物中,有2对引物可对霍山石斛及部分混伪品进行有效的鉴别.结论:所设计的引物可以对霍山石斛及其伪混品进行鉴别,且所得数据为霍山石斛的种群遗传和起源分化的研究提供了支持.