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芒果核苷二磷酸激酶(NDPK)基因克隆及表达分析
芒果核苷二磷酸激酶(NDPK)基因克隆及表达分析
作者:
党志国
罗睿雄
赵志常
高爱平
黄建峰
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
芒果
核苷二磷酸激酶
基因克隆
生物信息学分析
表达分析
摘要:
采用3'RACE和RT-PCR技术克隆芒果核苷二磷酸激酶基因全长cDNA序列,并用实时荧光定量PCR分析该基因的表达模式.结果表明:MiNDPK1基因cDNA全长1 019 bp,开放阅读框为447 bp,编码148个氨基酸.MiNDPK1蛋白定位于细胞质,无信号肽和跨膜区域,具有典型的核苷二磷酸激酶活性结构域和其他磷酸化活性位点;与麻疯树、橡胶树同源性最高为89%,与菠菜同源性最低为82%.MiNDPK1在芒果各组织中均有表达,以叶片中表达最高,其次是花和果皮;在芒果进入生殖时期的花芽分化期表达量最高,此后在芒果果实发育进程中逐渐降低并趋于平稳.结合病害处理转录组样本中的差异性表达结果,推测芒果MiNDPK1基因在花芽分化进程、抗病性诱导及免疫应答通路上发挥重要作用.
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篇名
芒果核苷二磷酸激酶(NDPK)基因克隆及表达分析
来源期刊
热带作物学报
学科
农学
关键词
芒果
核苷二磷酸激酶
基因克隆
生物信息学分析
表达分析
年,卷(期)
2016,(11)
所属期刊栏目
生物技术与组织培养
研究方向
页码范围
2183-2190
页数
8页
分类号
S667.7
字数
5032字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-2561.2016.11.024
五维指标
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核苷二磷酸激酶
基因克隆
生物信息学分析
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研究来源
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研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
热带作物学报
主办单位:
中国热带作物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-2561
CN:
46-1019/S
开本:
大16开
出版地:
海南省海口市龙华区学院路4号
邮发代号:
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
5760
总下载数(次)
12
总被引数(次)
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