猪流行性腹泻病毒云南流行毒株N基因序列分析

• 作者: 刘宁 姚俊 宋聪 李华春 李美荃 杨荣丽 石於友 高林
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 N基因 序列分析 云南株
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 15-19
• 页数: 5页
• 分类号: S852.659.6
• 字数: 3969字
• 语种: 中文

摘要

为了解近年来云南省 PEDV 流行毒株的变异情况，选取了采集自昆明西翥、富源、厂口、玉溪红塔等地方猪场的不同时间的6份 PEDV 阳性水样腹泻粪便样品，进行 N 基因的 RT-PCR 扩增、测序及序列分析。结果表明，来自同一猪场不同流行时间的 TY1、TY2、TY3毒株之间，TY1与 TY2毒株 N 基因核苷酸序列完全相同，仅 TY3毒株在第80和第1238位置处的碱基发生了变异（A→C、C→T），TY3与 TY1、TY2的毒株 N 基因核苷酸序列的同源性达99．8％。云南6个流行毒株 TY1、TY2、TY3、YXHT、FYDH 及Changkou 的核苷酸序列的同源性为99．2％～100％。云南6个流行毒株与2014年德国毒株 GER-L00721-2014（Accession：LM645057．1）、法国毒株 KR011756-FR001-2014（Accession：KR011756．1）及我国2010年河北毒株 JF700126．1-HB-HS-2010（Accession：LM645057．1）的核苷酸序列同源性为98．6％～100％，并同属于一个进化分支。云南6个流行毒株与 CV777经典疫苗毒株之间的同源性仅为95．2％～95．5％，存在一定的变异，这或许是云南省猪群经 PEDV 疫苗免疫后保护率较低的原因之一。