某医院船不同舱室微生物多样性初步研究

• 作者: 乔媛媛 付凯飞 刘英 周丽君 李军 王欲晓
• 来源期刊: 军事医学
• 学科: 医学
• 关键词: 海军医学 医院船 微生物多样性 Illumina测序 16SrDNA
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 海军医学
• 页码范围: 880-884
• 页数: 5页
• 分类号: R37
• 字数: 4344字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7644/j.issn.1674-9960.2016.11.007

摘要

目的：应用16S rDNA测序技术分析海军某医院船不同舱室细菌群落结构及其多样性，为医院船潜在感染的监测和控制提供科学依据。方法采用拭子涂抹方法在医院船的12个舱室（ A～L位）共采集样本31份，采用IlluminaHiseq2500高通量测序平台PE250测序策略对样品16S rDNA扩增的V3～V4区域进行测序，并进行物种分类、丰度及多样性等生物信息分析。结果31份样品共产生原始测序数据为1860．64 Mbp，每份样品平均产生54．86 Mbp的clean data序列，各样品检测的Tags数量平均为60000，Unique tags序列数量均值为58364；操作分类单元（ operational taxonomic units ， OTU）数量181～2239。在医院船12个舱室中共检测到26个细菌门纲目等类，216个细菌科，414个细菌属。其中在各级水平分布的优势菌群分别为厚壁菌门（Firmicutes）、葡萄球菌科（Staphylo－coccaceae ）和葡萄球菌属（ Staphylococcus）。在属水平，葡萄球菌属在L位和J位分布最多，微球菌属在B位分布最多（27．15％），不动杆菌属在K位占优势（23．83％），栖水菌属则主要见于C位。12个舱室两间共有的OTU数量占检测到OTU总数的比例均＜22．3％，其中K位有着最高的Chao指数（4711．55）和Shannon－Wiener指数（8．58），及最高的Simpson优势度指数（0．9905）。结论医院船菌群构成复杂、多样，以革兰阳性葡萄球菌为优势菌属，并有水生环境中的菌属分布，与陆地医院常见细菌分布存在明显差异，而且各舱室细菌物种丰度及分类也存在明显不同。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李军	海军总医院科研科	95	341	9.0	13.0
2	乔媛媛	海军总医院中心实验科	45	153	7.0	10.0
3	周丽君	海军总医院中心实验科	37	90	5.0	7.0
4	王欲晓	海军总医院中心实验科	29	62	5.0	5.0
5	付凯飞	海军总医院中心实验科	15	26	3.0	4.0
6	刘英	海军总医院感染控制办公室	9	29	3.0	5.0