禾本科8种牧草DNA条形码通用序列筛选

• 作者: 吴建平 姚喜喜 权金强 李永青 汪文强 焦婷 赵生国 郑王山 郭永博
• 来源期刊: 草业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 单倍型组合 matK基因 rbcL基因 DNA条形码 通用序列
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 植物生产层
• 页码范围: 1702-1710
• 页数: 9页
• 分类号: S540.37
• 字数: 5701字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11829/j.issn.1001-0629.2016-0039

摘要

DNA条形码技术是利用DNA保守片段对物种进行快速准确鉴定的新兴技术.本研究根据 GenBank 中禾本科牧草matK 和rbcL基因的核苷酸序列,设计4对通用引物,建立并优化了针对禾本科7个主要牧草属8种牧草11个样品[高丹草(Sorghum bicolor×S.sudanense)、玉米(Zea mays)、针茅(Stipa capillata)、“贝克”多年生黑麦草(Loli-um perenne ‘Plxie)、“凯帝莎”多年生黑麦草(L.perenne ‘Caddieshack’)、甘肃羊茅(Festuca kansuensis)、“百琪”紫羊茅(F.rubra ‘Bargena’)、“梦神”紫羊茅(F.rubra ‘Maxima’)、“百胜”草地早熟禾(Poa pratensis ‘Barvictor’)、“钻石”草地早熟禾(P.pratensis ‘Diamond’)和芨芨草(Achnatherum splendens)]的目的片段的扩增条件.对扩增产物进行测序和分析,经分别比对,筛选出8种牧草的4个标记位点5’端和3’端保守序列.对各标记位点保守区内的核苷酸进行单核苷酸多态性(SNPs)的单倍型分析.结果表明,matK1、matK2、matK3分别有6个单倍型(H1A、H1B、H1C、H1D、H1E 和 H1F)、7个单倍型(H2A、H2B、H2C、H2D、H2E、H2F 和 H2G)和3个单倍型(H3A、H3B 和 H3C),rbcL 基因有5个单倍型(H4A、H4B、H4C、H4D 和 H4E).根据matK(matK1、matK2、matK3)和rbcL 基因筛选的4个标记位点为8种牧草建立了相对应的特异DNA识别码.本研究可为混合禾本科牧草饲料中的高粱属、玉蜀黍属、芨芨草属、针茅属、黑麦草属、羊茅属和早熟禾属的8种牧草准确识别提供分子水平上的科学依据.