一株人感染H9N2禽流感病毒高通量测序及序列分析

• 作者: 吴衍恒 周日东 师舞阳 林金思 谢颖
• 来源期刊: 中华疾病控制杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 流感病毒A型,H9N2亚型 序列分析 结合部位
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1131-1134,1143
• 分类号: R373.13
• 语种: 中文
• DOI: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2016.11.014

摘要

目的 对一株人感染H9N2禽流感病毒进行高通量测序(next-generation sequencing,NGS)分析,探讨其在人群流行的可能性.方法 应用高通量测序技术进行全基因组序列测定(whole genome sequencing,WGS).对8个基因进行相似性检索,构建系统进化树并分析其关键位点的分子特征.结果 8个基因与GenBank基因库相似度最高序列的来源不完全一致,系统进化树显示HA基因属于欧亚系Ⅰ群,M基因位于G1-like分支,PB2位于G9-like分支,NA位于一独立分支,PBI,PA,NP,NS均位于SH/F/98-like分支.HA基因裂解位点为PSRSSR/GLF,226位受体结合位点为L.除M2基因S31N突变之外,NA基因茎63～65位缺失,PA和PB2基因未发生L336M和Q591R,E627K等可以增强病毒对哺乳动物适应性的突变,但发现可以增强病毒毒力的突变如M1基因N30D和T215A,PB2基因L89V,NS1基因P42S.除M2基因S31N突变外,NA基因和M2基因的药物结合位点未发生E119G,R152K,H274Y,R292K和L26F,V27A,A30T,G34E等耐药性突变.HA和NA糖基化位点预测结果都有8个糖基化位点,其中分别有7个和5个可靠程度较高.结论 该H9N2禽流感病毒的大部分关键性位点较保守,只有少部分位点发生一定程度进化与变异,在人群引起流行的可能性不大,但需加强分子方面动态监测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周日东	中山市疾病预防控制中心检验科	29	165	8.0	12.0
2	吴衍恒	中山市疾病预防控制中心检验科	13	22	2.0	4.0
3	师舞阳	中山市疾病预防控制中心检验科	15	36	3.0	5.0
4	谢颖	中山市疾病预防控制中心检验科	9	7	2.0	2.0
5	林金思	中山市疾病预防控制中心检验科	4	4	1.0	1.0