迟缓爱德华氏菌EcoR Ⅰ核糖体自动化分型与聚类分析

• 作者: 何苗 沈文淑 蔡强 韩伟 顾鸣 黄新新
• 来源期刊: 微生物学通报
• 关键词: 迟缓爱德华氏菌 Riboprinter分型 聚类分析
• 年，卷（期）: 2016,（10）
• 所属期刊栏目: 简报
• 页码范围: 2249-2253
• 语种: 中文
• DOI: 10.13344/j.microbiol.china.150881

摘要

[目的]对26株迟缓爱德华氏菌进行自动化核糖体分型,并进行聚类分析.[方法]采用RiboprinterTM全自动微生物鉴定系统对分离自斑点叉尾鮰、日本鳗、多宝鱼、比目鱼、斑醴等宿主体内的迟缓爱德华氏菌进行核糖体分型,以限制性内切酶EcoR Ⅰ处理、切割菌株DNA;运用BioNumerics软件分析图像数据.[结果]迟缓爱德华氏菌核糖体图谱与数据库中已有信息进行比对,ATCC 15947和BYK00685的比对相似值＞0.85,分别为0.95及0.90.条形码经软件分析共产生21种核糖体条带,聚类分析分为3个群.条带之间呈现明显的地域性差异和宿主差别.来自北方及南方的菌株除少数几株以外,各自聚集为一个群;所有人源株则分布在第三群.[结论]自动化核糖体分型可以方便快捷地用于不同物种的菌株分型与流行病学追踪溯源.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何苗	清华大学环境学院	82	1855	24.0	40.0
2	顾鸣	上海出入境检验检疫局动植物与食品检验检疫技术中心	33	239	8.0	14.0
3	韩伟	上海出入境检验检疫局动植物与食品检验检疫技术中心	35	247	8.0	15.0
4	蔡强		68	373	12.0	16.0
5	黄新新	上海出入境检验检疫局动植物与食品检验检疫技术中心	6	4	2.0	2.0
6	沈文淑	上海出入境检验检疫局动植物与食品检验检疫技术中心	1	0	0.0	0.0