基于金针菇全基因组的赖氨酸合成途径关键酶分析

• 作者: 刘建雨 尚晓冬 张丹 王瑞娟 谭琦
• 来源期刊: 微生物学通报
• 关键词: 金针菇 赖氨酸生物合成 α-氨基己二酸途径
• 年，卷（期）: 2016,（10）
• 所属期刊栏目: 食品微生物
• 页码范围: 2225-2233
• 语种: 中文
• DOI: 10.13344/j.microbiol.china.160379

摘要

[目的]以金针菇全基因组测序数据为基础研究其L-赖氨酸的从头合成途径及其关键基因.[方法]采用Illumina Hiseq2000和Roche454 FLX+两种方法完成金针菇单孢菌株Dan3的基因组测序,基于全基因组序列筛选金针菇中赖氨酸生物合成的关键基因,并分析这些基因编码的蛋白质基本理化性质;预测其亚细胞定位情况及蛋白的二级结构.[结果]金针菇Dan3全基因组序列长度为34.17 Mb,预测到8个参与α-氨基己二酸途径的关键基因,这些基因都含有多个内含子和外显子,二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,有3个蛋白定位于线粒体.[结论]金针菇是通过α-氨基己二酸途径合成赖氨酸,基因组中预测到与该途径相关的几乎所有的酶.