2011-2015年我国南方地区PEDV分子流行病学调查及S基因遗传变异分析

• 作者: 李智丽 毕英佐 马静云 黄淑坚
• 来源期刊: 广东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 动态监控 S基因 遗传变异
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医·水产养殖
• 页码范围: 127-135
• 页数: 9页
• 分类号: S855.3
• 字数: 4435字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16768/j.issn.1004-874X.2016.11.020

摘要

应用RT-PCR方法对南方地区五省(广东、广西、福建、四川、江苏)18个猪场7日龄以内发病仔猪的小肠组织和粪便样本进行猪流行性腹泻病毒(PEDV)检测,对9个猪场进行为期5年的动态监控,并对2011-2015年期间分离的35个PEDV流行株的S基因进行测序,与GenBank中的PEDV参考序列进行比较,并绘制了系统进化树.结果显示,上述地区五省存在Group1和Group 2两种类型毒株.Group1与美国、韩国毒株较为接近,可分为G1-1、G1-2、G1-3和G1-4等4个亚群,Group 2与2004年国内分离毒株较为接近,可分为G2-1、G2-2两个亚群.25个中国南方地区毒株集中于G1-2和G1-3,而另外8株与2004年国内毒株(JS-2004-2)同属G2-2亚群.不同类型的毒株引发的PEDV临床表现及死亡率不同,G2-2亚群的毒株引发的PED相对缓和,死亡率较低且病程较短,而位于G1-2和G1-3亚群(尤其是G1-3)的毒株则引起大规模急性暴发,病程较长,死亡率较高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	毕英佐	华南农业大学动物科学学院	216	2631	28.0	41.0
2	马静云	华南农业大学动物科学学院	87	548	13.0	19.0
3	黄淑坚	佛山科学技术学院生命科学与工程学院	47	144	7.0	9.0
4	李智丽	佛山科学技术学院生命科学与工程学院	16	21	2.0	4.0