杜洛克猪全基因组连锁不平衡分析

• 作者: 刁淑琪 张哲 张豪 李加琪 罗元宇 蔡迪 陈桂华 陈赞谋
• 来源期刊: 广东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 连锁不平衡 杜洛克 SNP
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医·水产养殖
• 页码范围: 116-121
• 页数: 6页
• 分类号: S828.2|Q343.1
• 字数: 2731字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16768/j.issn.1004-874X.2016.11.018

摘要

利用猪Illumina Porcine SNP60K芯片对福建某核心种猪场杜洛克猪216个个体进行基因型检测,基于该高密度SNP芯片数据,运用Haploview软件计算全基因组连锁不平衡并构建杜洛克猪连锁不平衡图谱.结果表明,该杜洛克猪群体不同染色体上相邻标记间r2存在波动,波动范围为0.46～ 0.59,相邻标记间的平均连锁不平衡程度r2为0.52,SSC 10的r2最低(平均为0.46),SSC6的r2最高(平均为0.59),连锁不平衡水平随着标记间距的增加而衰减、变异程度随之减小.该研究结果可为杜洛克猪遗传分析及全基因组选择研究提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈赞谋	华南农业大学动物科学学院	23	234	9.0	14.0
2	张豪	华南农业大学动物科学学院	48	298	10.0	15.0
3	李加琪	华南农业大学动物科学学院	57	384	11.0	17.0
4	陈桂华	华南农业大学动物科学学院	5	18	3.0	4.0
5	张哲	华南农业大学动物科学学院	12	63	4.0	7.0
6	刁淑琪	华南农业大学动物科学学院	2	3	1.0	1.0
7	罗元宇	华南农业大学动物科学学院	1	3	1.0	1.0
8	蔡迪	华南农业大学动物科学学院	1	3	1.0	1.0