不同产地太子参芜菁花叶病毒CP基因的分离与序列差异性分析

• 作者: 于静静 匡云波 叶炜 叶祖云 李金辉 赖钟雄
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 太子参 TuMV CP RT-PCR 序列差异性分析
• 年，卷（期）: 2016,（10）
• 所属期刊栏目: 作物病虫害及防治
• 页码范围: 1974-1979
• 页数: 6页
• 分类号: S432.1
• 字数: 4099字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2016.10.021

摘要

通过对不同产地的8份太子参病叶样品进行芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,TuMV)外壳蛋白(coat protein,CP)基因的RT-PCR检测,从其中7份样品中扩增得到特异性目的条带,对所获得的13个克隆子序列进行下一步的序列分析.结果显示:所得CP基因序列均为775 bp,存在36个核苷酸多态性位点,总变异数为37个,部分点突变仅在某产地发现,可能存在重组;各地分离物之间的遗传分化程度高,遗传漂变可能是造成遗传分化的主要原因;在系统进化树分析结果中,太子参TuMV CP序列均聚类在World B组,并呈现一定的地域特异性.本研究为建立更有效的太子参TuMV检测方法和针对性制定病毒病防控策略奠定重要基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	叶炜	三明市农业科学研究院药用植物研究所	16	100	6.0	9.0
3	叶祖云	宁德师范学院生物系	24	86	6.0	8.0
5	匡云波	宁德师范学院生物系	7	22	3.0	4.0
9	李金辉	宁德师范学院生物系	1	3	1.0	1.0
10	于静静	宁德师范学院生物系	1	3	1.0	1.0