北京市29例新确证HIV-1感染者多区段序列病毒亚型分析

• 作者: 宋川 张媛媛 杜鹏程 陈丹瑛 韩俊燕
• 来源期刊: 实用预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 男男性行为人群 HIV-1 基因测序 系统进化树 亚型特征
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1315-1318
• 页数: 4页
• 分类号: R512.91
• 字数: 2791字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-3110.2016.11.011

摘要

目的 了解北京市男男性行为人群(MSM)中,29例新确证HIV-1感染者病毒株的基因序列特征. 方法 对HIV-1感染者进行流行病学调查,采集全血,分离血浆提取病毒核酸,应用套式反转录聚合酶链式反应(nested reverse transcription-polymerase chain reaction,nested RT-PCR)分别扩增gag、env和pol基因的部分片段,并对扩增产物进行测序,用Mega 5.0软件将测序结果与各亚型国际参考株比对,根据基因序列离散度确定系统进化树,综合三个区域的分型结果分析基因型及其特征. 结果 分析样本中扩增阳性的基因序列,结果表明至少存在5种不同的HIV-1亚型和重组模式,包括3种常见CRF01_AE(48.4％),CRF07/08_BC(24.1％),B/B'亚型(10.3％),以及罕见重组型CRF01_AE/CRF07_BC(6.9％)和CRF01_AE/B(10.3％);V3环顶端四肽分析发现,共有五种类型的顶端四肽:GPGQ、GPGR、GPGG、GPGL和GPGP,主要以GPGQ为主(73.3％);辅助受体分析结果发现,CRF01_AE亚型和CRF01_AE/B亚型的样本中出现了预测为X4嗜性的毒株. 结论 北京地区MSM人群中29例HIV-1感染者病毒株遗传多样性高,来源复杂,且存在罕见CRF01_AE/CRF07_BC和CRF01_AE/B重组型,应当继续加强HIV-1分子流行病学特征的监测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韩俊燕	首都医科大学附属北京地坛医院传染病研究所新发突发传染病研究北京市重点实验室	9	26	3.0	4.0
2	杜鹏程	首都医科大学附属北京地坛医院传染病研究所新发突发传染病研究北京市重点实验室	7	5	2.0	2.0
3	陈丹瑛	首都医科大学附属北京地坛医院传染病研究所新发突发传染病研究北京市重点实验室	5	12	2.0	3.0
4	宋川	首都医科大学附属北京地坛医院传染病研究所新发突发传染病研究北京市重点实验室	1	2	1.0	1.0