牦牛 CAPN3基因的克隆及组织表达特异性

• 作者: 吴晓云 李明霞 潘和平 王英杰 阎萍
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 牦牛 CAPN3 基因 克隆 生物信息学分析 表达模式
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 149-155
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.01.025

摘要

以牦牛背最长肌为材料，采用 RT-PCR 法克隆了 CAPN3基因的 CDs 区，并对其进行生物信息学分析。结果表明，牦牛 CAPN3基因的 CDs 区长2469 bp，编码822个氨基酸残基；生物信息学分析显示，其编码的蛋白属于非分泌表面蛋白，含有35个磷酸化位点，主要在细胞质和细胞核中发挥生物学作用。二级结构主要由α-螺旋、无规则卷曲、伸展链和β-转角组成，具有CysPc、calpain-Ⅲ和 EFh 家族蛋白结构域，无信号肽。牦牛 CAPN3基因与黄牛、绵羊和猪在系统发育树上的距离最近。运用实时荧光定量分析 CAPN3在不同组织中的表达量，CAPN3基因在牦牛的7种组织中均有表达，但在背最长肌、胰脏中的表达量较高。