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白桦BpHMGR基因的结构及表达模式分析
白桦BpHMGR基因的结构及表达模式分析
作者:
周姗
曾凡锁
李思达
梁楠松
詹亚光
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
白桦
3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶
生物节律
一氧化氮
生物信息学分析
摘要:
目的 研究白桦Betula platyphylla3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(3-hydroxy-3-methyl-glutaryl-CoA reductase,BpHMGR)全长基因结构特征及编码蛋白性质,揭示其节律表达模式以及对外源NO信号分子的响应机制.方法 通过RACE技术克隆白桦BpHMGR基因,应用生物信息学软件对BpHMGR及其编码蛋白进行详细分析,利用实时荧光定量PCR定量分析BpHMGR基因在昼夜节律变化中的表达模式.根据BpHMGR氨基酸序列构建系统进化树,分析昼夜节律以及外源NO对白桦叶片中BpHMGR转录水平的影响.结果 BpHMGR基因全长1 764 bp,包含完整开放阅读框,已上传至NCBI,并获得登录号KJ452334,其编码蛋白由587aa组成.白桦BpHMGR基因与大豆(XP 003519474.1)、葡萄(XP_002275827.1)、苜蓿(XP 003617066.1)亲缘关系较近.结论 BpHMGR随昼夜周期变化呈现出节律表达特性,在夜晚21:00时达到峰值.初步揭示了外源NO能诱导白桦细胞内二萜代谢途径的关键酶BpHMGR基因上调表达,进而促进三萜产物齐墩果酸的合成.
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篇名
白桦BpHMGR基因的结构及表达模式分析
来源期刊
中草药
学科
医学
关键词
白桦
3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶
生物节律
一氧化氮
生物信息学分析
年,卷(期)
2016,(6)
所属期刊栏目
药材与资源
研究方向
页码范围
982-989
页数
分类号
R282.12
字数
语种
中文
DOI
10.7501/j.issn.0253-2670.2016.06.021
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
詹亚光
东北林业大学生命科学学院
162
1654
19.0
35.0
2
曾凡锁
东北林业大学生命科学学院
49
459
10.0
20.0
3
周姗
东北林业大学生命科学学院
7
17
3.0
4.0
4
梁楠松
东北林业大学生命科学学院
8
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3.0
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李思达
东北林业大学生命科学学院
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引文网络
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共引文献
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(0)
二级引证文献
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期刊影响力
中草药
主办单位:
天津药物研究院
中国药学会
出版周期:
半月刊
ISSN:
0253-2670
CN:
12-1108/R
开本:
大16开
出版地:
天津市南开区鞍山西道308号
邮发代号:
6-77
创刊时间:
1970
语种:
chi
出版文献量(篇)
14898
总下载数(次)
32
总被引数(次)
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