典型超微细菌降解邻苯二甲酸二丁酯的途径及水合酶的表达纯化研究

• 作者: 孙瑞 权伟 王莹莹 马丹
• 来源期刊: 农业环境科学学报
• 关键词: 超微细菌 邻苯二甲酸酯 水合酶 X射线衍射 蛋白表达纯化
• 年，卷（期）: 2016,（10）
• 所属期刊栏目: 水体环境
• 页码范围: 1992-1997
• 页数: 6页
• 分类号: X171.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.11654/jaes.2016-1010

摘要

典型超微细菌菌株PAE-UM属于β-变形菌门丛毛单胞菌属（Curvibacter sp.），是革兰氏阴性菌株，可利用DBP作为唯一碳源。利用流式细胞仪检测细菌生长情况，并采用高效液相色谱测定DBP的浓度，结果显示该菌对DBP的降解率为94%，菌株最大生长速率为0.2372 h-1。已经完成了该菌株的全基因组测序，GenBank登录号为LKCX00000000。通过全基因组数据分析及文献对比发现该菌在降解邻苯二甲酸二丁酯的途径中，4-oxalomesaconate水合酶（OMH）是原儿茶酸间位裂解代谢途径中的关键酶，具有催化4-oxalomesaconate（OMA）降解为4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate（CHA）的能力，该酶是降解邻苯二甲酸酯过程中的关键酶之一，也是芳香化合物降解过程中的重要降解酶。利用蛋白结晶技术及分子生物学手段，对关键酶（OMH）进行分子构建，表达、纯化、结晶的筛选，应用X-ray衍射技术对关键酶的晶体进行衍射，获得晶体的衍射数据，进行关键酶的三维结构解析。Curvibacter sp. PAE-UM菌株中的OMH蛋白在大肠杆菌中得到表达，经多种方法纯化后筛选获得了纯度大于95%的蛋白，并经试剂盒筛选获得高质量的蛋白质晶体。在上海光源同步辐射（SSRF）BL-19U线站收集数据，通过X射线衍射实验收集到分辨率达到2.00魡的衍射数据，并使用软件HKL2000进行了数据处理与修正，该OMH的结构解析为2.00?。后续将通过该关键酶的三维结构的解析进一步阐明该菌降解PAEs的分子机理。